一些引起诱发免疫应激反应的疾病，如传染性支气管炎、非典型新城疫和产蛋综合症等，会导致蛋壳腺萎缩，影响蛋壳的色泽。沙门氏菌和大肠杆菌的轻度感染则会影响输卵管蛋壳腺的分泌，出现所谓的沙皮蛋。许多小型的饲料厂在产蛋鸡浓缩料中添加少量的抗菌素，反而有助于蛋壳质量的改善，就是这个原因。
饲料中的成分一样有影响。比如饲料中缺乏钙，蛋壳质量变差。钙添加过多，会导致蛋壳和壳上膜的钙沉积过多，钙的沉积过度又会使蛋壳的颜色变淡，色调变差。再如饲料中磷过多，破蛋率会增多，磷过少，则产蛋率下降等。
综合上述原因来看，蛋壳的颜色与其包裹着的蛋白和蛋黄的形成没有什么关联，而我们所需求的营养，基本都是来自于蛋白和蛋黄。所以说挑选鸡蛋还是不要太看重蛋壳的颜色，仅凭颜色也很难判断哪种鸡蛋更有营养。在鸡蛋的选择上，还是以新鲜为主。 | 
